اهداف گسترش و بهبود داده های مبنایی، چارچوبهای مرجع و زیرساخت داده های مکانی برای مشارکت مؤثر در برنامه ریزی و توسعه پایدار کشور ؛ تحکیم مرجعیت سازمان در تدوین و توسعه استانداردها و الزامات فنی به منظور تضمین کیفیت، تعامل پذیری و پایایی؛ ارتقای تعاملات برون سازمانی در سطوح ملی، منطقه ای و بین المللی به منظور افزایش اثرگذاری سازمان؛ افزایش سطح تعاملات اجتماعی سازمان در راستای شناخت متقابل سازمان و جامعه؛ گسترش فعالیت های پژوهشی سازمان با تأکید بر تحقیقات کاربردی و توسعه ای؛ پیشنهاد و پیگیری تصویب قوانین و مقررات به منظور تقویت نقش حاکمیتی سازمان؛ ایفای نقش کلیدی در پیش آگهی و مدیریت بحران؛ ارتقای نقش سازمان نقشه برداری در نظام فنی و اجرایی کشور؛ تسهیل و تسریع دسترسی عموم به محصولات و خدمات مختلف سازمان؛ توسعه و بروز رسانی فن آوری ها و محصولات جدید؛ توسعه منابع درآمدی پایدار؛ ارتقای سازمان به سازمانی چابک، یادگیرنده و بهره ور.
وظایف طراحی و اجرای عملیات نقشه برداری بنیادی از قبیل ایجاد شبکه های سراسری ژئودزی، ترازیابی دقیق، ثقل سنجی و ژئودینامیک؛ بروز رسانی نقشه های مبنایی کشور در مقیاس 1:25،000 و مقیاس های دیگر در راستای برنامه های توسعه اقتصادی، اجتماعی و فرهنگی کشور؛ تعیین و بهبود سطوح مبنای نقشه برداری از قبیل: ژئویید ملی و محلی، بیضوی های مقایسه، سطوح مبنای ارتفاعات و سیستم های تصویر مناسب؛ ایجاد ایستگاههای دائمی تعیین موقعیت ماهواره ای، فضایی و ارائه خدمات مربوط؛ تهیه نقشه های مورد نیاز و بروز رسانی آنها برای طرحهای عمرانی وزارتخانه ها و سازمان های دولتی و بخش خصوصی؛ انجام عکسبرداری های هوایی و تهیة فیلم، تصویر رقومی و پردازش های مربوط مورد نیاز دستگاههای دولتی و بخش خصوصی؛ طراحی و ایجاد سیستم های اطلاعات مکانی(GIS)، سیستم های اطلاعات زمینی (LIS) و تشکیل پایگاه داده های توپوگرافی ملی (NTDB)؛ عملیات آب نگاری (هیدروگرافی) شامل تهیة چارتهای مبنایی و موردی، جمع آوری و پردازش اطلاعات جزر و مدی ، پیش بینی و تهیة جداول جزر و مدی؛ طرح و اجرای پروژة اطلس ملی ایران و اطلس های موضوعی و به روز رسانی و بازنگری آنها؛ گردآوری و بایگانی اطلاعات جغرافیایی و نسخة اصلی نقشه ها به منظور ایجاد بانک اطلاعاتی؛ اعمال ممیزی های کیفی فعالیت های نقشه برداری؛ تهیه و تدوین استانداردها و دستورالعمل های لازم برای ایجاد یکپارچگی و انسجام در مراحل کار فنی و اجرایی سازمان و سایر موسسات و نهادهای فعال در عرصه های مرتبط؛ نظارت و کنترل کیفی بر تمام فعالیت های تهیة نقشه در موسسات و بخش های دولتی و خصوصی طبق استانداردهای بین المللی؛ عضویت در انجمن های علمی و فنی بین المللی و منطقـه ای در زمینـه هـای علـوم مهندسی نقشه برداری با رعایت قوانین و مقررات مربوط؛ همکاری با مجامع علمی- فنی داخل و خارج و تبادل اطلاعات با این مجامع؛ برگزاری دوره های آموزشی در زمینه های مهندسی نقشه برداری در حیطة مقررات مربوط؛ برگزاری کنگره ها، کنفرانس ها و سمینارهای مرتبط بـــا مهندسی نقشه برداری در سطح ملی، منطقه ای و بین المللی و شرکت در همایش های داخلی و خارجی ذیربط؛ همکاری لازم برای تحقق وظایف شورای عالی نقشه برداری. تهیه، تالیف و انتشار نقشه های توپوگرافی در مقیاس های مختلف با استفاده از اطلاعات گردآوری شده به روش های زمینی، فتوگرامتری و یا جنرالیزه اطلاعات موجود. طراحی، اجرا، به روز رسانی و انتشار نقشه های موضوعی. تدوین، طراحی، اجرا، به روز رسانی و انتشار اطلس های ملی، منطقه ای و موضوعی. طراحی، اجرا و انتشار انواع نقشه های موضوعی و گردشگری. طراحی، تولید و انتشار انواع محصولات کارتوگرافی مانند مدل سه بعدی و نقشه های سه بعدی. نگهداری، به روز رسانی و تکمیل پایگاه ملی نام های جغرافیایی ایران.